Podobnie jak w poprzednim sezonie, Werder II po raz kolejny uniknął spadku w ostatnim dniu meczowym, ponownie wygrywając... z VFR Aalen. Tym samym Werder II wyprzedził SC Paderborn w tabeli, zdobywając jeden punkt i zajmując 17. miejsce.
Później tego samego lata 1860 München, które spadło z 2. Bundesligi, wpadło w kłopoty finansowe i nie otrzymało miejsca w sezonie 2017/18 3. Liga 2017/18. Oznaczało to, że SC Paderborn zachowa swoje miejsce w 3. lidze i nie spadnie z ligi.