Pierwsza drużyna rezerw powstała z drugiej drużyny SSV Markranstädt. Jej inauguracyjny sezon przypadł na lata 2009-10 w ...Bezirkslidze Leipzig. Drużyna zajęła pierwsze miejsce i wywalczyła awans do Sachsenligi 2010-11. W ramach umowy z SSV Markranstädt, drużyna powróciła do SSV Markranstädt po sezonie 2009-10 i grała w Sachsenlidze 2010-11 jako nowa pierwsza drużyna.
Aby zastąpić drużynę rezerw i uniknąć konieczności rozpoczynania rozgrywek z drużyną rezerw z dolnej części systemu niemieckiej ligi piłkarskiej, RB Leipzig nawiązał współpracę z ESV Delitzsch z Delitzsch w północno-zachodniej Saksonii. RB Lipsk przyjął pierwszą drużynę ESV Delitzsch jako swoją nową drużynę rezerw i wykupił jej prawo do gry w Berzirkslidze Lipsk.[1] Drużyna ponownie zajęła pierwsze miejsce i wywalczyła awans do Sachsenligi 2011-12, aby zmierzyć się z pierwszą drużyną SSV Markranstädt.
W obliczu zbliżającego się bankructwa FC Sachsen Leipzig, które upadło w czerwcu 2011 r., RB Lipsk rozważał zakup prawa do gry w Oberlidze dla swojej drużyny rezerw, ale później wycofał swoją ofertę. Warunkiem przejęcia było to, że co najmniej 51 procent zawodników drużyny musiało zostać włączonych do nowego klubu, ale RB Lipsk zamiast tego zdecydował się na rozwój własnej drużyny rezerw.[2][3]
Tino Vogel został mianowany głównym trenerem na sezon 2011-12. Do drużyny dołączył starszy obrońca Ingo Hertzsch, który opuścił profesjonalną drużynę. Drużyna rezerw zajęła czwarte miejsce w Sachsenlidze. Ligę wygrał SSV Markranstädt, który odzyskał prawo gry w Oberlidze.[4] Drużyna zakończyła sezon 2012-13 Sachsenligi na trzecim miejscu. Drużyna zajęła pierwsze miejsce w Sachsenlidze 2013-14 i wywalczyła awans do NOFV-Oberliga Süd. Napastnik Tom Nattermann strzelił 32 gole w sezonie, kończąc sezon 2013-14 Sachsenligi jako najlepszy strzelec ligi z dużym marginesem[5][6].
Sezon 2014-15 obejmował takich przeciwników jak SSV Markranstädt i 1. FC Lokomotive Leipzig,[7] ale drużyna rezerw z powodzeniem przystosowała się do Oberligi i zaczęła dominować. Drużyna zakończyła sezon 2014-15 NOFV-Oberliga Süd na pierwszym miejscu i wywalczyła awans do Regionalliga Nordost. Nattermann strzelił 26 goli, pokonując jedynie Jana Nezmara z FC Oberlausitz Neugersdorf[8].
Przed sezonem 2015-16 prawie połowa zawodników z poprzedniego sezonu opuściła drużynę, w tym Nattermann, który odszedł do FC Erzgebirge Aue.[8] Nowi zawodnicy prawie wszyscy pochodzili z własnych szeregów klubu, w tym sześciu zawodników z drużyny juniorów A.[9][10] Drużyna rezerw zakończyła swój pierwszy sezon w Regionalliga na 11. miejscu.
Obecny trener juniorów B Robert Klauß został mianowany głównym trenerem na sezon 2016-17, zastępując Vogela.[11][12] Vogel kontynuował karierę w klubie jako skaut w środkowych Niemczech, podczas gdy jego były asystent trenera Olaf Holetschek kontynuował jako skaut w juniorskiej piłce nożnej.[13] Drużyna została wzmocniona przez większą liczbę graczy z drużyny juniorów A, a także 19-letni talent Dominik Martinović z drużyny juniorów Bayern Monachium A.[14] Drużyna rezerw była najmłodszą w Regionalliga przed sezonem 2016-17. Średnia wieku w czerwcu 2016 roku wynosiła 19 lat i 5 miesięcy[15].
RB Lipsk rozwiązał drużynę U23 po sezonie 2016-17, zachowując jednocześnie drużyny U19 i U17
RB Leipzig II
Nike
