L'Atlas è stato fondato nel 1916 ed è uno dei club calcistici più antichi del Messico. L'Atlas gioca le sue partite casalinghe all'Estadio Jalisco, situato a Guadalajara. Lo stadio ha una storia im...portante nel calcio messicano e ha ospitato numerose partite importanti, tra cui quelle della Coppa del Mondo.
Il kit tradizionale dell'Atlas è composto da una metà rossa e una nera.
L'Atlas ha un'accesa rivalità locale con il Chivas de Guadalajara, nota come "Clásico Tapatío". Le partite tra Atlas e Chivas sono tra le più intense e attese del calcio messicano.