O Salamanca AC foi criado em 28 de junho de 2013, para substituir o UD Salamanca, que acabou por ser dissolvido por caus...a de problemas financeiros. Inicialmente colocado na Tercera División, a Real Federação Espanhola de Futebol deixou o clube entrar na Segunda División B pouco tempo depois, mas no fim das contas ele não se inscreveu para jogar em nenhuma competição. O clube também não apareceu na campanha seguinte. O mesmo aconteceu antes da temporada 2015-16.
Em julho de 2016, o Supremo Tribunal finalmente deu razão à Real Federação Espanhola de Futebol, o que provavelmente significaria o fim do projeto Salamanca AC.