L'AFC Wimbledon a été fondé en 2002 par des supporters du Wimbledon Football Club d'origine, qui avait été délocalisé et rebaptisé Milton Keynes Dons (MK Dons).
Le club a été créé en r�...�ponse au déménagement controversé du Wimbledon FC à Milton Keynes, qui a laissé un vide pour le football dans la région de Wimbledon.
L'AFC Wimbledon a débuté dans les niveaux inférieurs du football anglais et a progressé dans le système de la ligue.
Le club est très attaché à sa communauté et à ses supporters, et son ascension dans les ligues a été remarquable.
Le maillot domicile de l'AFC Wimbledon arbore traditionnellement les couleurs primaires de l'équipe, à savoir le bleu et le jaune.